关于企业所得税的优惠政策中，研发费用按照据实扣除的基础上，再按照实际发生额的100%在税前加计扣除，优惠力度很大，也是税务重点检查稽核的对象。通过几个稽查案例分析税务关注的5个重点问题。
与研发无关的人员工资计入研发费用
研发支出的人员人工费用，指直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费。
会计人员工资列入研发费用，包税三稽罚﹝2024﹞9号：经我局检查，你公司会计宁彩荣工资按工时分配计入研发费用人员工资，会计宁彩荣在笔录中承认并未参与研发工作。
无关人员工资列入研发费用，宁税稽二罚[2024]121号：经核查，除柳某因电话空号无法联系外，其余自然人均表示2019年前在该企业仅短暂的干过两三个月，2021年、2022年均未在你单位任职，且均不从事研发活动。乌税稽罚〔2024〕16号：两位公司高管虽然参加了课题组的指导工作，但只是挂名，并未实际参与课题的具体研究开发工作，你单位在2021年企业所得税研发费用加计扣除中多列支高管人员工资、差旅费、社保费、医保费。
人员工资没有按工时划分，仙税稽罚﹝2023﹞16号：其他的都是既从事研发工作，又从事非研发工作，经询问你公司财务负责人肖义，确定你公司未对从事研发活动同时从事非研发活动的人员活动情况做记录，也未对用于研发活动同时用于非研发活动的仪器、设备的使用情况做记录。
行业不符，不享受研发支出加计扣除
不适用税前加计扣除政策的行业：1.烟草制造业、2.住宿和餐饮业、3.批发和零售业、4.房地产业、5.租赁和商务服务业、6.娱乐业。
有些商贸企业（批发和零售业）、服务业将自己公司包装成科技型公司，但是没有忽略了工商公式的行业性质与税务系统的行业性质不符，违规享受研发费用加计扣除。
销售下脚料和研发试制品，没有扣减研发支出
企业研发活动直接形成产品或作为组成部分形成的产品对外销售的，研发费用中对应的材料费用不得加计扣除。企业取得研发过程中形成的下脚料、残次品、中间试制品等特殊收入，在计算确认收入当年的加计扣除研发费用时，应从已归集研发费用中扣减该特殊收入，不足扣减的，加计扣除研发费用按零计算。
该点是很多生产制造业在归集研发支出容易忽略的问题点，也是税务重点关注的问题点。
长税稽罚〔2024〕30号：你单位2020年1月1日至2022年12月31日对研发过程中产生的边角料、残次品、中间试制品的收入未做研发费用材料费用的冲减，而是直接以废品收入计入营业外收入-其他科目中。
北税稽罚〔2024〕10号：你单位把研发活动直接形成的产成品对外销售，将用于研发活动形成产成品(包括组成部分)对应的材料部分费用加计扣除，造成你单位合计多填列免税、减计收入及加计扣除合计9,361,398.05元。
甬税稽三罚〔2024〕6号：所有产品已发出，款项由你公司以现金方式收款，未开具发票。上述匿报研发试制品销售收入、研发下脚料收入的行为，未冲减研发费用，并加计扣除。
研发活动（立项）不符合相关规定
研发活动，是指企业为获得科学与技术新知识，创造性运用科学技术新知识，或实质性改进技术、产品(服务)、工艺而持续进行的具有明确目标的系统性活动。
下列活动不适用税前加计扣除政策。
1.企业产品(服务)的常规性升级。
2.对某项科研成果的直接应用，如直接采用公开的新工艺、材料、装置、产品、服务或知识等。
3.企业在商品化后为顾客提供的技术支持活动。
4.对现存产品、服务、技术、材料或工艺流程进行的重复或简单改变。
5.市场调查研究、效率调查或管理研究。
6.作为工业(服务)流程环节或常规的质量控制、测试分析、维修维护。
7.社会科学、艺术或人文学方面的研究。
柳市税三稽罚〔2024〕13号：你公司2020年度共申报3项研发费用加计扣除项目，上述研发项目属于对现存产品、服务、技术、材料或工艺流程进行的重复或简单改变，不适用研发费用税前加计扣除政策。
资料备案不齐全
企业享受税收优惠时，采取“自行判别、申报享受、相关资料留存备查”的办理方式，在年度纳税申报及享受优惠事项前无需再履行备案手续、也无需再报送备案资料，原备案资料全部作为留存备查资料保留在企业
但是如果税务机关定期核查时，发现相关资料不齐全，税务机关有权对其税前扣除额或加计扣除额进行合理调整。并且税务机关年度核查面不得低于20%。
淄博税稽二罚〔2024〕2号：你单位2022年研发费加计扣除2,247,436.33元，无法提供研发项目的立项书或者立项的相关文件、从事研发活动的人员和用于研发活动的仪器、设备、无形资产的费用分配说明等资料，不符合研发费加计扣除政策。
吉市税三稽罚〔2023〕5号：你单位2019-2021年未将研究开发项目计划书、决议文件、费用分配说明、研发支出辅助账等资料留存备查，将不符合规定的研发支出加计扣除，存在编造虚假计税依据的行为。
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